Diagnostic des TPI

Le diagnostic étiologique d’une thrombopénie est souvent difficile. Différencier une cause centrale (due à une production médullaire de plaquettes insuffisante) d’une cause périphérique (due à une destruction accélérée des plaquettes) est crucial. Une ponction de moelle osseuse pour évaluer la production de mégacaryocytes (précurseurs plaquettaires) peut être nécessaire, mais elle est invasive et ne permet pas de diagnostic formel.8 Il est en particulier délicat de distinguer une thrombopénie constitutionnelle (monogénique) d’origine centrale, d’une TPI qui est une cause périphérique et uniquement un diagnostic d’exclusion. Devant une suspicion de thrombopénie constitutionnelle, il est de plus nécessaire de rechercher des variants constitutionnels. Il a été récemment montré que le transcriptome plasmatique (cell-free messenger RNA) reflétait la production médullaire et permettait d’inférer sa composition cellulaire.9,10 Il est également possible de rechercher les variants constitutionnels à partir du transcriptome,11 mais cela n’a pas été étudié dans le transcriptome plasmatique ni dans les thrombopénies constitutionnelles.
L’hypothèse de ce projet est que l’analyse de la composition cellulaire par séquençage du transcriptome plasmatique pourra différencier les causes centrales et périphériques de thrombopénie de manière non invasive. À partir du même test, il pourrait également permettre de rechercher des variants de thrombopénie constitutionnelle. L’objectif est de séquencer le transcriptome plasmatique de patients avec TPI et avec thrombopénie constitutionnelle pour : 1) évaluer s’il est possible de discriminer les deux causes à partir de la fraction du transcriptome plasmatique d’origine mégacaryocytaire; 2) rechercher s’il est possible d’identifier les variants de thrombopénies constitutionnelles à partir du transcriptome plasmatique. Ce projet est effectué en collaboration avec le Dr Donald M. Arnold (Hamilton, ON) qui dispose d’échantillons sanguins dont du plasma de 779 patients adultes avec thrombopénie inclus dans le McMaster ITP (immune thrombocytopenia) Registry, intégrant un suivi prospectif et spécifiant le diagnostic final retenu. Nous sélectionnerons 40 patients avec un diagnostic final de TPI et 40 avec un diagnostic de thrombopénie constitutionnelle d’origine centrale dont nous séquencerons le transcriptome plasmatique. À partir de la déconvolution des données transcriptomiques,10 nous comparerons la production mégacaryocytaire entre les deux catégories (puissance de 90% de détecter une différence de x1,4). Pour les patients avec thrombopénie constitutionnelle ayant eu un variant identifié par séquençage de l’ADN, nous évaluerons si ce variant peut être identifié sur le transcriptome plasmatique. Le transcriptome plasmatique pourrait donc représenter le premier outil disponible, simple et non invasif, pour distinguer les thrombopénies immunes des thrombopénies constitutionnelles centrales, pédiatrique comme adulte étant donné les mécanismes identiques.